引發肉芽腫性胃炎的病因較多且復雜，它可以是系統性疾病的一部分，也可由非特異性致病因子引發，稱為非特異性肉芽腫性胃炎。

　　1、胃的霉菌感染：主要見于含珠菌病、組織漿菌病、毛霉菌病和放線菌病，多發生于免疫功能低下的全身衰弱患者。白色念珠菌在胃的潰瘍或糜爛底部和邊緣可找到；組織漿菌病往往可并發胃出血，出血來源于巨大皺襞的潰瘍或糜爛；毛霉菌病典型病變是胃的深潰瘍、出血和穿孔，潰瘍邊緣有黑色硬結。

　　2、結核桿菌感染：其主要病變在腸道，但已有報告發現胃結核，粘膜活檢如找到特征性的干酪性肉芽腫可確診。

　　3、胃梅毒：其特點是皺襞增厚，一般伴有糜爛，特征類似于惡性腫瘤。二期梅毒胃粘膜病理變化無特異性，炎癥細胞浸潤程度較高；二期晚期、三期梅毒時出現肉芽腫反應，其診斷依據是找到梅毒螺桿菌。

　　4、Crohn病胃炎：很少見，發生于胃竇部和幽門，十二指腸、小腸和結腸常同時被侵犯。

　　5、結節病侵犯胃腸道：很少見，一般可見有幽門梗阻或胃腸出血，胃鏡可發現胃粘膜呈皮革樣外觀、潰瘍、糜爛和胃皺襞增粗。肉芽腫常在病灶邊緣發現。